Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BBOX1O75936 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BBOX1O75936 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
BBOX1O75936 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
BBOX1O75936 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BBOX1O75936 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BBOX1O75936 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
BBOX1O75936 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BBOX1O75936 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BBOX1O75936 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
BBOX1O75936 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BBOX1O75936 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BBOX1O75936 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BBOX1O75936 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BBOX1O75936 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BBOX1O75936 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BBOX1O75936 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BBOX1O75936 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BBOX1O75936 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BBOX1O75936 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
BBOX1O75936 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
BBOX1O75936 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
BBOX1O75936 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BBOX1O75936 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BBOX1O75936 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms