Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPN15O75808 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN15O75808 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms