Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms