Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR5O60602 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR5O60602 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR5O60602 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR5O60602 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR5O60602 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR5O60602 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR5O60602 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR5O60602 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR5O60602 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR5O60602 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR5O60602 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR5O60602 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR5O60602 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR5O60602 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR5O60602 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR5O60602 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR5O60602 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR5O60602 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR5O60602 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR5O60602 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR5O60602 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR5O60602 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR5O60602 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR5O60602 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR5O60602 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR5O60602 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR5O60602 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR5O60602 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR5O60602 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR5O60602 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR5O60602 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR5O60602 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR5O60602 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR5O60602 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR5O60602 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR5O60602 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TLR5O60602 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TLR5O60602 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TLR5O60602 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR5O60602 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR5O60602 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR5O60602 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR5O60602 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR5O60602 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR5O60602 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR5O60602 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR5O60602 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR5O60602 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR5O60602 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR5O60602 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR5O60602 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR5O60602 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR5O60602 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR5O60602 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR5O60602 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR5O60602 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR5O60602 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR5O60602 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR5O60602 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR5O60602 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR5O60602 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR5O60602 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR5O60602 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR5O60602 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR5O60602 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR5O60602 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR5O60602 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR5O60602 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR5O60602 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR5O60602 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR5O60602 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR5O60602 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR5O60602 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR5O60602 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR5O60602 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR5O60602 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR5O60602 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR5O60602 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR5O60602 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR5O60602 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR5O60602 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR5O60602 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR5O60602 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR5O60602 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR5O60602 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR5O60602 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR5O60602 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR5O60602 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR5O60602 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR5O60602 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR5O60602 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR5O60602 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR5O60602 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR5O60602 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR5O60602 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR5O60602 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR5O60602 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR5O60602 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR5O60602 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms