Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms