Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN4O43707 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms