Protein–RNA interactions for Protein: O15259

NPHP1, Nephrocystin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP1O15259 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
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NPHP1O15259 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP1O15259 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP1O15259 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP1O15259 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP1O15259 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP1O15259 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP1O15259 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP1O15259 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP1O15259 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP1O15259 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP1O15259 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP1O15259 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP1O15259 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP1O15259 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP1O15259 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
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NPHP1O15259 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPHP1O15259 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPHP1O15259 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPHP1O15259 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPHP1O15259 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NPHP1O15259 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
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NPHP1O15259 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPHP1O15259 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPHP1O15259 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
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NPHP1O15259 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPHP1O15259 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
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NPHP1O15259 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NPHP1O15259 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
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NPHP1O15259 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPHP1O15259 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
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NPHP1O15259 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
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NPHP1O15259 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
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NPHP1O15259 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPHP1O15259 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
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NPHP1O15259 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NPHP1O15259 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NPHP1O15259 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NPHP1O15259 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPHP1O15259 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPHP1O15259 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPHP1O15259 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
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