Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSP2O14595 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms