Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms