Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms