Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP2O00295 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP2O00295 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP2O00295 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP2O00295 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP2O00295 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP2O00295 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TULP2O00295 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TULP2O00295 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TULP2O00295 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP2O00295 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP2O00295 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP2O00295 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP2O00295 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP2O00295 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP2O00295 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP2O00295 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP2O00295 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP2O00295 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP2O00295 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP2O00295 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP2O00295 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP2O00295 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP2O00295 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP2O00295 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP2O00295 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP2O00295 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP2O00295 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP2O00295 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP2O00295 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP2O00295 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP2O00295 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP2O00295 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP2O00295 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP2O00295 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP2O00295 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP2O00295 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP2O00295 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP2O00295 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP2O00295 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP2O00295 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP2O00295 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP2O00295 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP2O00295 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP2O00295 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP2O00295 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP2O00295 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP2O00295 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP2O00295 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP2O00295 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP2O00295 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP2O00295 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP2O00295 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP2O00295 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP2O00295 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP2O00295 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP2O00295 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP2O00295 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP2O00295 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP2O00295 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP2O00295 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP2O00295 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP2O00295 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP2O00295 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP2O00295 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP2O00295 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP2O00295 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP2O00295 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP2O00295 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP2O00295 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP2O00295 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP2O00295 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP2O00295 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP2O00295 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP2O00295 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP2O00295 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP2O00295 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP2O00295 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP2O00295 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP2O00295 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP2O00295 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP2O00295 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP2O00295 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP2O00295 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP2O00295 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP2O00295 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP2O00295 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP2O00295 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP2O00295 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP2O00295 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP2O00295 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP2O00295 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP2O00295 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP2O00295 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP2O00295 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TULP2O00295 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TULP2O00295 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TULP2O00295 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TULP2O00295 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TULP2O00295 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms