Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E9PBE3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E9PBE3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E9PBE3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E9PBE3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E9PBE3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E9PBE3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E9PBE3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E9PBE3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E9PBE3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E9PBE3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E9PBE3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E9PBE3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E9PBE3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E9PBE3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E9PBE3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
E9PBE3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E9PBE3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E9PBE3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E9PBE3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E9PBE3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E9PBE3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E9PBE3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E9PBE3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E9PBE3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E9PBE3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E9PBE3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E9PBE3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E9PBE3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E9PBE3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E9PBE3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E9PBE3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E9PBE3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E9PBE3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E9PBE3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E9PBE3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E9PBE3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E9PBE3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E9PBE3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E9PBE3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E9PBE3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E9PBE3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E9PBE3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E9PBE3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E9PBE3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E9PBE3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
E9PBE3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E9PBE3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E9PBE3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E9PBE3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E9PBE3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E9PBE3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E9PBE3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
E9PBE3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E9PBE3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
E9PBE3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E9PBE3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PBE3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PBE3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PBE3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PBE3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PBE3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PBE3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PBE3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PBE3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PBE3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PBE3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PBE3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PBE3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PBE3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PBE3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PBE3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PBE3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PBE3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PBE3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PBE3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E9PBE3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E9PBE3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E9PBE3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E9PBE3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E9PBE3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E9PBE3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E9PBE3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E9PBE3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E9PBE3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E9PBE3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E9PBE3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E9PBE3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E9PBE3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E9PBE3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E9PBE3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E9PBE3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E9PBE3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E9PBE3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E9PBE3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E9PBE3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E9PBE3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E9PBE3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
E9PBE3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E9PBE3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms