Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVV-2B6SEH9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVV-2B6SEH9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERVV-2B6SEH9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERVV-2B6SEH9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERVV-2B6SEH9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERVV-2B6SEH9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms