Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
YJEFN3A6XGL0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms