Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC69A6NI79 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms