Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L4A6NCW7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms