Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms