Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC37.55■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
LAMC3Q9Y6N6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC37.5■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC37.47■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
LAMC3Q9Y6N6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
LAMC3Q9Y6N6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
LAMC3Q9Y6N6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
LAMC3Q9Y6N6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
LAMC3Q9Y6N6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
LAMC3Q9Y6N6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC37.44■■■■□ 3.58
LAMC3Q9Y6N6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms