Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAD1L1Q9Y6D9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MAD1L1Q9Y6D9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms