Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
GTF3C3Q9Y5Q9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF3C3Q9Y5Q9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms