Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM50BQ9Y247 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms