Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FZD1Q9UP38 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms