Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRID1Q9ULK0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms