Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
INO80Q9ULG1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
INO80Q9ULG1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms