Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3Q9UKS6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms