Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.6 ms