Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RRBP1Q9P2E9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RRBP1Q9P2E9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms