Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHRF1Q9P1Y6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PHRF1Q9P1Y6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHRF1Q9P1Y6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms