Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HMG20BQ9P0W2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms