Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXXC1Q9P0U4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXXC1Q9P0U4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms