Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYOFQ9NZM1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MYOFQ9NZM1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYOFQ9NZM1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYOFQ9NZM1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYOFQ9NZM1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms