Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms