Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMPD3Q9NY59 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms