Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC38A7Q9NVC3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A7Q9NVC3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms