Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TDP1Q9NUW8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TDP1Q9NUW8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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