Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms