Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCND1Q9NSA2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCND1Q9NSA2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCND1Q9NSA2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms