Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMYD2Q9NRG4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms