Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
HPS4Q9NQG7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms