Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB9BQ9NP90 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB9BQ9NP90 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms