Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PNPLA8Q9NP80 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms