Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms