Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIPAS39Q9H9C1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms