Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCAS3Q9H6U6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 331.9 ms