Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSS3Q9H6R3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms