Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STN1Q9H668 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STN1Q9H668 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms