Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00597Q9H2U6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms