Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1E5

TMX4, Thioredoxin-related transmembrane protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4Q9H1E5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMX4Q9H1E5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TMX4Q9H1E5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms