Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms