Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
INO80BQ9C086 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms